Datos de investigación
Simulaciones de Dinámica Molecular de monocapas de DPPC en ausencia y presencia de fluralaner
Publicador:
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Fecha de depósito:
16/01/2023
Fecha de creación:
03/08/2021
Clasificación temática:
Resumen
Simulaciones de Dinámica Molecular (SDM) de detalle atómico de monocapas de DPPC en ausencia y presencia de fluralaner, en diferentes estados de empaquetamiento molecular del fosfolípido.
Información de Series
SDM de monocapas de DPPC en ausencia de fluralaner: archivos nombrados "DPPC_nombredelarchivo_n" donde n = 0, 10, 20, 25 40 y corresponde al valor de presión simulado.
SDM de monocapas de DPPC en presencia de fluralaner: archivos nombrados "DPPC-FLURA_nombredelarchivo_n" donde n = 0, 10, 20, 25 40 y corresponde al valor de presión simulado.
Información Técnica
Las simulaciones se realizaron con un ensamble N γ P z T.
Software: GROMACS v.2018.6 con aceleración de GPU.
Campo de fuerza: GAFF para el fluralaner, All Atom Slipid para los lípidos. Modelo TIP3P para el agua.
Temperatura: 298 K.
Tiempo de simulación: 300 ns.
Presión superficial simulada: 0, 10, 20, 25, 40 mN/m.
Palabras clave:
Simulaciones de Dinámica Molecular,
DPPC,
Fluralaner,
Isoterma de compresión
Previsualización destacada
Identificador del recurso
Colecciones
Datos de Investigación(IIBYT)
Datos de Investigación de INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOLOGICAS Y TECNOLOGICAS
Datos de Investigación de INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOLOGICAS Y TECNOLOGICAS
Citación
Gastaldi, María Salomé; (2023): Simulaciones de Dinámica Molecular de monocapas de DPPC en ausencia y presencia de fluralaner. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/184842
Condiciones de uso
Las buenas prácticas científicas esperan que se otorgue el crédito adecuado mediante una citación. Utilice un formato de citación y aplique estas normas de reutilización.
Compartir
Archivos del conjunto de datos
Archivo
Notas de uso
Tamaño
DPPC_trajout_10.xtc
Más
45.97Mb
DPPC_trajout_20.xtc
Más
45.94Mb
DPPC_confin_40.gro
Más
1.872Mb
DPPC_topol.top
Más
247bytes
DPPC-FLURA_surf_tens_40.mdp
Más
2.326Kb
DPPC-FLURA_confin_25.gro
Más
1.840Mb
DPPC-FLURA_trajout_40.xtc
Más
45.09Mb
DPPC_surf_tens_40.mdp
Más
2.326Kb
DPPC_surf_tens_20.mdp
Más
2.326Kb
DPPC_trajout_0.xtc
Más
46.04Mb
DPPC-FLURA_surf_tens_25.mdp
Más
2.326Kb
DPPC_confin_20.gro
Más
1.872Mb
DPPC-FLURA_index.ndx
Más
1.120Mb
DPPC_surf_tens_0.mdp
Más
2.326Kb
DPPC_trajout_40.xtc
Más
45.86Mb
DPPC-FLURA_trajout_0.xtc
Más
45.26Mb
DPPC-FLURA_confin_20.gro
Más
1.840Mb
DPPC-FLURA_trajout_10.xtc
Más
45.22Mb
DPPC-FLURA_confin_10.gro
Más
1.840Mb
DPPC-FLURA_surf_tens_0.mdp
Más
2.326Kb
DPPC-FLURA_topol.top
Más
244bytes
DPPC_index.ndx
Más
1.132Mb
DPPC-FLURA_trajout_25.xtc
Más
45.14Mb
DPPC_surf_tens_10.mdp
Más
2.326Kb
DPPC-FLURA_confin_0.gro
Más
1.840Mb
DPPC_surf_tens_25.mdp
Más
2.326Kb
DPPC_confin_0.gro
Más
1.872Mb
DPPC-FLURA_surf_tens_10.mdp
Más
2.325Kb
DPPC_trajout_25.xtc
Más
45.91Mb
DPPC_confin_25.gro
Más
1.872Mb
DPPC-FLURA_confin_40.gro
Más
1.840Mb
DPPC_confin_10.gro
Más
1.872Mb