Datos de investigación
Datos crudos obtenidos mediante metabarcoding del gen 16S de un efluente citrícola pre y post tratamiento biológico
Autores:
Benitez, Silvana Florencia
; Tatarin, Ana Silvia
; Zapata, Pedro Dario
; Sadañoski, Marcela Alejandra
; Levin, Laura Noemí
; Fonseca, Maria Isabel
; Saguchi, Evelin Yuriko
; Tatarin, Ana Silvia
; Zapata, Pedro Dario
; Sadañoski, Marcela Alejandra
; Levin, Laura Noemí
; Fonseca, Maria Isabel
; Saguchi, Evelin Yuriko
Publicador:
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Fecha de depósito:
19/02/2024
Fecha de creación:
01-2022
Clasificación temática:
Resumen
El conjunto de datos corresponde a secuencias de ARNr 16S obtenidas mediante NGS con Illumina Miseq. El ADN fue extraído de aguas residuales de cítricos antes y después del tratamiento biológico con la cepa fúngica Pleurotus pulmonarius LBM 105 inmovilizada en esponja vegetal. El objetivo era identificar los cambios en las comunidades bacterianas luego del tratamiento.
Información Técnica
Para la extracción de ADN genómico, se centrifugó 50 mL de agua residual de cítricos filtrada (control y tratamiento en triplicado) a 4000 x g durante 10 minutos para obtener un pellet. El ADN fue extraído utilizando el kit NucleoSpin® Soil (Biocientífica SA, ARGENTINA) siguiendo las recomendaciones del fabricante y enviado a Macrogen Inc. (Seúl, República de Corea) para PCR, construcción de la biblioteca de amplicones y secuenciación (Illumina Miseq). El tratamiento consistió en 10 días de incubación a 28 °C con 1 g de esponja vegetal (trozos de 1 cm3) y 3 tapones de agar de P. pulmonarius LBM 105 cultivados en agar de extracto de malta. Los ensayos se realizaron en matraces Erlenmeyer de 250 mL.
Palabras clave:
METABARCODING,
COMUNIDADES BACTERIANAS,
EFLUENTE CITRÍCOLA
Previsualización destacada
Fin del embargo:
08-03-2025
Identificador del recurso
Colecciones
Datos de Investigación(CCT - NORDESTE)
Datos de Investigación de CTRO.CIENTIFICO TECNOL.CONICET - NORDESTE
Datos de Investigación de CTRO.CIENTIFICO TECNOL.CONICET - NORDESTE
Datos de Investigación(INMIBO (EX - PROPLAME))
Datos de Investigación de INSTITUTO DE MICOLOGIA Y BOTANICA
Datos de Investigación de INSTITUTO DE MICOLOGIA Y BOTANICA
Citación
Benitez, Silvana Florencia; Tatarin, Ana Silvia; Zapata, Pedro Dario; Sadañoski, Marcela Alejandra; Levin, Laura Noemí; Fonseca, Maria Isabel; Saguchi, Evelin Yuriko; (2024): Datos crudos obtenidos mediante metabarcoding del gen 16S de un efluente citrícola pre y post tratamiento biológico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/227478
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