Datos crudos obtenidos mediante metabarcoding del gen 16S de un efluente citrícola pre y post tratamiento biológico

Name: Datos crudos obtenidos mediante metabarcoding del gen 16S de un efluente citrícola pre y post tratamiento biológico
License: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Keywords: METABARCODING

Datos de investigación

Datos crudos obtenidos mediante metabarcoding del gen 16S de un efluente citrícola pre y post tratamiento biológico

Autores: Benitez, Silvana Florencia Icon

; Tatarin, Ana Silvia Icon

; Zapata, Pedro Dario Icon

; Sadañoski, Marcela Alejandra Icon

; Levin, Laura Noemí Icon

; Fonseca, Maria Isabel Icon

; Saguchi, Evelin Yuriko

Publicador: Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas

Fecha de depósito: 19/02/2024

Fecha de creación: 01-2022

Clasificación temática:

Biotecnología Medioambiental

Resumen

El conjunto de datos corresponde a secuencias de ARNr 16S obtenidas mediante NGS con Illumina Miseq. El ADN fue extraído de aguas residuales de cítricos antes y después del tratamiento biológico con la cepa fúngica Pleurotus pulmonarius LBM 105 inmovilizada en esponja vegetal. El objetivo era identificar los cambios en las comunidades bacterianas luego del tratamiento.

Información Técnica

Para la extracción de ADN genómico, se centrifugó 50 mL de agua residual de cítricos filtrada (control y tratamiento en triplicado) a 4000 x g durante 10 minutos para obtener un pellet. El ADN fue extraído utilizando el kit NucleoSpin® Soil (Biocientífica SA, ARGENTINA) siguiendo las recomendaciones del fabricante y enviado a Macrogen Inc. (Seúl, República de Corea) para PCR, construcción de la biblioteca de amplicones y secuenciación (Illumina Miseq). El tratamiento consistió en 10 días de incubación a 28 °C con 1 g de esponja vegetal (trozos de 1 cm3) y 3 tapones de agar de P. pulmonarius LBM 105 cultivados en agar de extracto de malta. Los ensayos se realizaron en matraces Erlenmeyer de 250 mL.

Palabras clave: METABARCODING, COMUNIDADES BACTERIANAS, EFLUENTE CITRÍCOLA

Previsualización destacada

Identificador del recurso

URI: http://hdl.handle.net/11336/227478

Colecciones

Datos de Investigación(CCT - NORDESTE)
Datos de Investigación de CTRO.CIENTIFICO TECNOL.CONICET - NORDESTE

Datos de Investigación(INMIBO (EX - PROPLAME))
Datos de Investigación de INSTITUTO DE MICOLOGIA Y BOTANICA

Citación

Benitez, Silvana Florencia; Tatarin, Ana Silvia; Zapata, Pedro Dario; Sadañoski, Marcela Alejandra; Levin, Laura Noemí; Fonseca, Maria Isabel; Saguchi, Evelin Yuriko; (2024): Datos crudos obtenidos mediante metabarcoding del gen 16S de un efluente citrícola pre y post tratamiento biológico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/227478

Condiciones de uso

Las buenas prácticas científicas esperan que se otorgue el crédito adecuado mediante una citación. Utilice un formato de citación y aplique estas normas de reutilización.

Excepto donde se diga explícitamente, este item se publica bajo la siguiente descripción: Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 2.5 Unported (CC BY-NC-SA 2.5)