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dc.date.available
2024-05-08T09:51:13Z  
dc.identifier.citation
Moya, Sofía Lorián; (2024): Biblioteca de Códigos de Barra genéticos de Phlebotominae de Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/234815  
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/234815  
dc.description.abstract
Secuencias de ADN, fragmento COI utilizado como código de barra genético, de los primeros ejemplares de la bilbioteca de códigos de barra genéticos de 19 especies Phlebotominae de Argentina. Estas secuencias fueron generadas en la tesis doctoral de SL Moya, son parte del proyecto PHLAR de la plataforma BOLD (aún no disponible) y están subidas a GenBank con los números de acceso PP620154-PP620288.  
dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess  
dc.title
Biblioteca de Códigos de Barra genéticos de Phlebotominae de Argentina  
dc.type
dataset  
dc.date.updated
2024-05-07T14:51:04Z  
dc.description.fil
Fil: Moya, Sofía Lorián. Administracion Nacional de Laboratorios E Institutos de Salud "dr. Carlos G. Malbran". Instituto Nacional de Medicina Tropical.; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina  
dc.rights.license
Datos sujetos al derecho de propiedad intelectual  
dc.datacite.PublicationYear
2024  
dc.datacite.Creator
Moya, Sofía Lorián  
dc.datacite.affiliation
Administracion Nacional de Laboratorios E Institutos de Salud "dr. Carlos G. Malbran". Instituto Nacional de Medicina Tropical.  
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas  
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas  
dc.datacite.affiliation
Administracion Nacional de Laboratorios E Institutos de Salud "dr. Carlos G. Malbran". Instituto Nacional de Medicina Tropical.  
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas  
dc.datacite.affiliation
Administracion Nacional de Laboratorios E Institutos de Salud "dr. Carlos G. Malbran". Instituto Nacional de Medicina Tropical.  
dc.datacite.publisher
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas  
dc.datacite.subject
Zoología, Ornitología, Entomología, Etología  
dc.datacite.subject
Ciencias Biológicas  
dc.datacite.subject
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS  
dc.datacite.subject
Medicina Tropical  
dc.datacite.subject
Ciencias de la Salud  
dc.datacite.subject
CIENCIAS MÉDICAS Y DE LA SALUD  
dc.datacite.subject
Epidemiología  
dc.datacite.subject
Ciencias de la Salud  
dc.datacite.subject
CIENCIAS MÉDICAS Y DE LA SALUD  
dc.datacite.ContributorType
Other  
dc.datacite.ContributorType
Other  
dc.datacite.ContributorName
Quintana, María Gabriela  
dc.datacite.ContributorName
Salomón, Oscar Daniel  
dc.datacite.date
01/04/2021  
dc.datacite.DateType
Creado  
dc.datacite.language
spa  
dc.datacite.version
1.0  
dc.datacite.description
Los flebótomos utilizados fueron seleccionados segun representatividad geográfica y taxonómica a partir los ejemplares capturados en la provincia de Misiones, y otros obtenidos por derivación provenientes de proyectos y estudios de foco llevados a cabo por la Red de investigación de las leishmaniasis en Argentina. Los flebótomos capturados se procesaron individualmente diseccionandose extremidades (patas y/o alas) para conservarse a modo de váuchers de tejido en alcohol para la posterior extracción de ADN. El resto del cuerpo fue aclarado para la observación y registro fotográfico de caracteres morfológicos bajo microscopio óptico binocular Carl Zeiss con cámara incorporada AxioCam ERc 5s. Las determinaciones se realizaron según la clave taxonómica de Galati (2018). Los ejemplares obtenidos por derivación fueron determinados por observación de caracteres morfológicos presentes en cabeza y genitalia.Una vez realizadas las determinaciones, se seleccionaron los ejemplares para la biblioteca teniendo en cuenta la especie, el sitio de captura y el estado del ejemplar que posibilitare una posterior revisión de los caracteres morfológicos. En el caso de los ejemplares obtenidos por derivación, cuya extracción de ADN se realizó a partir de cuerpo entero, se priorizaron aquellos que tuviesen registro fotográfico de los caracteres morfológicos de valor taxonómico. Extracción de ADN, amplificación y secuenciación: las extracciones de ADN genómico total se realizaron con kits comerciales INBIO HW ADN Puriprep-S y Transgen Biotech con modificaciones a partir de instrucciones del fabricante. El rendimiento de las extracciones fue evaluado mediante cuantificación con fluorómetro Qubit™ y amplificación por PCR del gen cacophony constitutivo del genoma de Diptera. La amplificación del fragmento barcode del gen COI se realizó según protocolo descrito por Hebert et al. (2003) utilizando los cebadores sentido LCO1490 y antisentido HCO219845. Los productos obtenidos se separaron en gel de agarosa al 2 % teñidos con SYBR® Safe DNA (Invitrogen, USA) y visualizados con luz azul de 470 nm. De cada producto amplificado se realizó la secuenciación de ambas cadenas de ADN complementarias en un equipo ABI 3730XLs (Macrogen, Korea) o en el Centre of Biodiversity Genomics (CBG), Universidad de Guelph, Canadá. Los cromatogramas de las secuencias sentido y antisentido se evaluaron según pureza y señal de los picos de fluorescencia de los archivos “.AB1”, generándose secuencias consenso de cada ejemplar con los programas Chromas Lite151 y MEGA-X v10. La identidad de las secuencias obtenidas se contrastó con las disponibles en las bases de datos online empleando las herramientas de Basic Local Alignment Search Tool (BLAST-NCBI) y la plataforma BOLD.  
dc.datacite.DescriptionType
Métodos  
dc.datacite.FunderName
Administracion Nacional de Laboratorios E Institutos de Salud  
dc.datacite.FunderName
CENTRE FOR BIODIVERSITY GENOMICS  
dc.relationtype.isSourceOf
https://drive.google.com/file/d/10Ubazd__GRS3IV5YtveTVrrM5JXDDhVE/view  
dc.relationtype.isSourceOf
https://drive.google.com/file/d/10Ubazd__GRS3IV5YtveTVrrM5JXDDhVE/view  
dc.subject.keyword
PHLEBOTOMINAE  
dc.subject.keyword
BARCODING  
dc.subject.keyword
VECTORES LEISHMANIASIS  
dc.subject.keyword
TAXONOMIA INTEGRATIVA  
dc.datacite.resourceTypeGeneral
dataset  
dc.conicet.datoinvestigacionid
15584  
dc.datacite.geolocation
Tucumán  
dc.datacite.geolocation
Jujuy  
dc.datacite.geolocation
Salta  
dc.datacite.geolocation
Formosa  
dc.datacite.geolocation
Chaco  
dc.datacite.geolocation
Entre Ríos  
dc.datacite.geolocation
Misiones  
dc.datacite.geolocation
Corrientes  
dc.datacite.formatedDate
2021  

Archivo
Notas de uso
Tamaño
Secuencias_COI_v1_-_Data.csv
Información asociada a las secuencias de la biblioteca  Más
11.83Kb
Moya2024seqsSNs_fasta
Secuencias en formato .fasta  Más
90.26Kb
 
 
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