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Datos de investigación

Secuencias genéticas parciales de Otaria flavescens: tRNA-Pro gene and control region; mitochondrial

Autores: Grandi, Maria FlorenciaIcon ; Loizaga de Castro, RocioIcon ; Teran, Ester MercedesIcon ; Santos, María RitaIcon ; Bailliet, GracielaIcon ; Crespo, Enrique AlbertoIcon
Publicador: Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Fecha de depósito: 15/08/2024
Fecha de creado: 1/1/2018-1/6/2018
Clasificación temática:
Genética y Herencia

Resumen

Colony formation is related to dispersal, philopatry, conspecific attraction, available suitable habitat, proximity and availability of food resources, and reproductive success. In this study we analyzed if female South American sea lions, (SASL, Otaria flavescens), exhibit natal fidelity at a small geographic scale (between colonies of the same breeding area) in a context of a recovering population with population expansion and recolonization. We examined the mitochondrial genetic diversity and investigated spatial genetic structure, considering new and traditional colonies. We recovered 36 haplotypes (23 novel), with the contemporary presence of common and private haplotypes in each colony. AMOVA analysis indicated no population genetic structure, however Fst , SAMOVA and AIS analyses suggested some level of genetic structure between northern and southern colonies. Therefore female SASL display different strategies when they choose where to breed: some are residents of -or return to- one particular colony whereas others disperse within the study area. In conclusion the recolonization of SASL may be the effect of weak female philopatry attenuated and/or interacting with other processes like site fidelity to near-by feeding grounds, breeding success, terrestrial habitat selection for breed and dispersal.

Métodos

Total genomic DNA was extracted using a modified salting outprocedure (Miller et al., 1988). Due to females being the focusof the study, a ?550 bp fragment of the maternally inheritedmtDNA control region (D-loop) was amplified using the primersL16274 (5-TACACTGGTCTTGTAAACC-3; Lamont et al., 1996) andH34 (5-CCAAATGCATGACACCACAG-3; Stanley et al., 1996) withthe following PCR profile: 2 min at 92?C; then 35 cycles at 94?C, 1.50?C, 72?C of 1 min each step and a final extension phase of 10 minat 72?C. All PCRs (50 ul, final volume) contained: 5 ul of DNA tem-plate (approximately 50 ng), 5 ul of Buffer (10×), 1.5 ul of MgCl2[50 mM], 3.75 ul of dNTPs [20 mM], 1 ul of each primer [0.25 pM],0.2 unit Taq polymerase (Invitrogen). Purification and sequenc-ing reactions were conducted by Macrogen Inc. (Seoul, Korea).Sequences were aligned manually using BioEdit (Hall, 1999).
Palabras clave: Colony formation, mtDNA, Natal site fidelity, Otaria flavescens, Patagonia
Alcance geográfico
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Alcance geográfico

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Identificador del recurso
URI: http://hdl.handle.net/11336/242546
Colecciones
Datos de Investigación(CESIMAR)
Datos de Investigación de CENTRO PARA EL ESTUDIO DE SISTEMAS MARINOS
Datos de Investigación(IMBICE)
Datos de Investigación de INST.MULTIDISCIPL.DE BIOLOGIA CELULAR (I)
Citación
Grandi, Maria Florencia; Loizaga de Castro, Rocio; Teran, Ester Mercedes; Santos, María Rita; Bailliet, Graciela; Crespo, Enrique Alberto; (2024): Secuencias genéticas parciales de Otaria flavescens: tRNA-Pro gene and control region; mitochondrial. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/242546
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Las buenas prácticas científicas esperan que se otorgue el crédito adecuado mediante una citación. Utilice un formato de citación y aplique estas normas de reutilización.
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  • Artículo Is recolonization pattern related to female philopatry? An insight into a colonially breeding mammal
    Grandi, Maria Florencia ; Loizaga de Castro, Rocio ; Teran, Ester Mercedes ; Santos, María Rita ; Bailliet, Graciela ; Crespo, Enrique Alberto (Elsevier Gmbh, 2018-03)

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