WGS of high risk clone ST147 Klebsiella pneumoniae coharboring mcr-1 and blaNDM-1

Name: WGS of high risk clone ST147 Klebsiella pneumoniae coharboring mcr-1 and blaNDM-1
License: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Keywords: Klebsiella pneumoniae

Datos de investigación

WGS of high risk clone ST147 Klebsiella pneumoniae coharboring mcr-1 and blaNDM-1

Autores: Di Conza, José Alejandro Icon

; Gutkind, Gabriel Osvaldo Icon

; Gonzales Escalante, Edgar Icon

; Ruggiero, Melina Icon

Colaboradores: Lincopan, Nilton

Publicador: Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas

Fecha de depósito: 13/01/2025

Fecha de creación: 17/02/2021

Clasificación temática:

Enfermedades Infecciosas

Resumen

In this work, we report the first genome sequence of an international critical clone of MCR-1-, NDM-1-, and CTXM-15-producing K. pneumoniae ST147 in Peru, highlighting cocarriage of multiple drug resistance determinants.

Métodos

Whole-genome sequencing of K. pneumoniae COL17 was performed through short reads (NextSeq, Illumina Paired-end PE platform) and long reads (MinION; Oxford Nanopore Technologies). De novo long-read-only assembly was performed with Flye v 2.6 followed by short-read polishing with Pilon v 1.20.1.

Palabras clave: Klebsiella pneumoniae, ST147, MCR-1, NDM-1

Alcance geográfico

.

Identificador del recurso

URI: http://hdl.handle.net/11336/252334

Colecciones

Datos de Investigación(OCA HOUSSAY)
Datos de Investigación de OFICINA DE COORDINACION ADMINISTRATIVA HOUSSAY

Citación

Di Conza, José Alejandro; Gutkind, Gabriel Osvaldo; Gonzales Escalante, Edgar; Ruggiero, Melina; (2025): WGS of high risk clone ST147 Klebsiella pneumoniae coharboring mcr-1 and blaNDM-1. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/252334

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