MTs-oscilations-EMD-automatic-analysis

Abstract

El presente es un algoritmo que realiza el cálculo automático de la energía e intensidad de las frecuencias oscilatorias de experimentos de microtúbulos con la técnica de Patch Clamp. En resumen, el script toma los archivos .abf, filtra el ruido eléctrico y las frecuencias más altas, separa el registro de corrientes por voltaje, hace recortes de un segundo, y a través de la descomposición empírica de señales (EMD), las mismas son descompuestas en funciones de modo intrínseco (IMF), y para cada función, con una frecuencia determinada, se realizan los cálculos de energía implicada en cada una de las mismas. A partir de estos resultados, se construyen gráficos de HHT, de energía en función de la frecuencia y un espectrograma de la frecuencia en función del voltaje, que muestra la intensidad de la energía implicada para cada una de ellas. Para todo el registro eléctrico, se realizan los mencionados recortes de un segundo y se promedian los resultados para cada voltaje.