Estudio de la dinámica conformacional de CYP101 en dependencia del ligando

Abstract

El estudio mediante simulaciones de Dinámica Molecular del sistema modelo P 450 cam en ausencia de ligando, nos permitió constatar su heterogeneidad o plasticidad conformacional. En consonancia con estudios previos, logramos caracterizar tres estados con distintas fracciones de población: un estado abierto, relacionado con la estructura cristalina que utilizamos como partida de nuestras simulaciones, un estado cerrado, que resultó ser el más poblado y un estado intermedio o semiabierto, que podría conectar los otros dos estados extremos. La diferenciación de estos estados, fue realizada en base a la distancia entre los centros de masa de los residuos Pro89 (hélice B ′ ) y Ser190 (loop F/G), que tomamos como parámetro de control del grado de apertura del canal de ingreso de ligandos.