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dc.date.available
2024-02-26T11:15:43Z
dc.identifier.citation
Acosta, Juan Manuel; Zanotti, Christian Alejandro; (2024): Matriz molecular concatenada del marcador nuclear ITS y de los marcadores cloroplastidiales matK, rbcL y atpB para determinar la ubicación filogenética de Pycnophyllum macropetalum y probar la monofilia del genero Pycnophyllum. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/228296
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/228296
dc.description.abstract
REDESCUBRIMIENTO Y CONFIRMACIÓN DE LA PRESENCIA DE PYCNOPHYLLUM MACROPETALUM (CARYOPHYLLACEAE) PARA LA FLORA ARGENTINA Pycnophyllum macropetalum Matff. is a species originally described for the Andes of Chile which has also been collected in Bolivia and in Argentina. Presence of P. macropetalum in Argentina is based on a single sterile specimen collected in 1945. For these reason and because P. macropetalum is morphologically very similar to P. molle, the species was excluded from the Argentinian flora; however, recently, a population of P. macropetalum has been located in the province of Jujuy (Argentina). Therefore, the objective of this work is to describe and to illustrate this species, to provide environmental notes about the habitat where it was found, and to provide a map of the geographic distribution of the species for Argentina, Bolivia and Chile. Furthermore, based on molecular analyzes of the collected specimen, the morphological identification is corroborated, and the monophyly of the genus is confirmed. Finally, a dichotomous key is provided to differentiate the four Pycnophyllum species recorded in Argentina.
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.title
Matriz molecular concatenada del marcador nuclear ITS y de los marcadores cloroplastidiales matK, rbcL y atpB para determinar la ubicación filogenética de Pycnophyllum macropetalum y probar la monofilia del genero Pycnophyllum
dc.type
dataset
dc.date.updated
2024-02-26T10:54:58Z
dc.description.fil
Fil: Acosta, Juan Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica Darwinion. Academia Nacional de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Instituto de Botánica Darwinion; Argentina
dc.description.fil
Fil: Zanotti, Christian Alejandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica Darwinion. Academia Nacional de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Instituto de Botánica Darwinion; Argentina
dc.datacite.PublicationYear
2024
dc.datacite.Creator
Acosta, Juan Manuel
dc.datacite.Creator
Zanotti, Christian Alejandro
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica Darwinion. Academia Nacional de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Instituto de Botánica Darwinion
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica Darwinion. Academia Nacional de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Instituto de Botánica Darwinion
dc.datacite.publisher
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
dc.datacite.subject
Ciencias de las Plantas, Botánica
dc.datacite.subject
Ciencias Biológicas
dc.datacite.subject
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.datacite.date
2023/2023
dc.datacite.DateType
Creado
dc.datacite.language
spa
dc.datacite.AlternateIdentifierType
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/URL - Uniform Resource Locator
dc.datacite.version
1.0
dc.datacite.description
Los análisis filogenéticos se llevaron a cabo tanto para los marcadores individuales como para el conjunto concatenados; se emplearon las metodologías de Máxima Parsimonia (MP) y Máxima Verosimilitud (MV). Las secuencias de cloroplasto (matK, rbcL y atpB) combinadas en una matriz y la nuclear (ITS) fueron analizadas por separado para evaluar posibles conflictos topológicos entre ellas. Debido a la ausencia de incongruencias para los clados con alto soporte, se procedió al análisis del conjunto concatenado. En todos los casos, los gaps fueron tratados como datos faltantes. El análisis de MP se realizó utilizando el programa TNT v.1.1 (Goloboff et al., 2008). La búsqueda de las topologías óptimas se llevó a cabo mediante búsquedas heurísticas con 10000 réplicas de adición al azar (“random addition sequences”, RAS), intercambio de ramas por TBR (“tree-bisection-and-reconnection”), y guardando 10 árboles por réplica. Los árboles óptimos obtenidos fueron sujetos a una nueva ronda de intercambio de ramas por TBR hasta encontrar las topologías más parsimoniosas. El árbol de consenso estricto fue obtenido por búsqueda heurística. Los valores de apoyo de los nodos se estimaron mediante análisis de Bootstrap Support (BS) con 10000 réplicas de 10 secuencias de adición al azar, guardando 10 árboles por réplica. Los análisis de MV se llevaron a cabo utilizando el programa RAxML v.8.0.0 (Stamatakis, 2014). El algoritmo implementado permite ejecutar búsquedas de árboles óptimos y obtención de valores de apoyo de ramas [i.e., “bootstrap support” (BS)] en un único análisis (Felsenstein, 1985; Stamatakis et al., 2008); para ello fueron ejecutadas 1000 réplicas de BS con una búsqueda posterior del árbol de máxima verosimilitud.
dc.datacite.DescriptionType
Métodos
dc.datacite.FunderName
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
dc.subject.keyword
Argentina
dc.subject.keyword
Caryophyllaceae
dc.subject.keyword
phylogeny
dc.subject.keyword
Pycnophyllum
dc.datacite.resourceTypeGeneral
dataset
dc.conicet.datoinvestigacionid
14487
dc.conicet.justificacion
Datos moleculares para analisis filogenéticos
dc.datacite.formatedDate
2023
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