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dc.date.available
2025-04-03T09:06:04Z
dc.identifier.citation
Maté, María Laura; Liron, Juan Pedro; Cantón, Candela; (2025): Gastrointestinal nematodes ITS-2 rDNA and β-tubulin deep amplicon sequencing from 6 cattle farms located in Buenos Aires province, Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/257859
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/257859
dc.description.abstract
In this study we applied the faecal egg count reduction test (FECRT), ITS2 and β-tubulin isotype 1 (β-tub-1) deep amplicon sequencing to assess, for the first time, the patterns of benzimidazole (BZD) resistance in gastrointestinal nematode (GIN) species infecting cattle from large-scale farms in Argentina subjected to different anthelmintic treatment strategies.
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.title
Gastrointestinal nematodes isotype-1 beta-tubulin and ITS2 deep amplicon sequencing from 6 cattle farms located in Buenos Aires province, Argentina
dc.type
dataset
dc.date.updated
2025-04-03T09:01:58Z
dc.description.fil
Fil: Maté, María Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; Argentina
dc.description.fil
Fil: Liron, Juan Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; Argentina
dc.description.fil
Fil: Cantón, Candela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; Argentina
dc.datacite.PublicationYear
2025
dc.datacite.Creator
Maté, María Laura
dc.datacite.Creator
Liron, Juan Pedro
dc.datacite.Creator
Cantón, Candela
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil
dc.datacite.publisher
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
dc.datacite.subject
Otras Ciencias Veterinarias
dc.datacite.date
01/04/2025
dc.datacite.DateType
Recolectado
dc.datacite.language
eng
dc.datacite.version
1.0
dc.datacite.description
British breed cattle and their crossbreeds, representative of the beef production systems in Buenos Aires province, Argentina, were used for fecal sampling over a period of approximately two years across six commercial farms operating under a grazing-based finishing system. The efficacy of BZDs and IVM in each commercial farm included in the project was previous to the feces sampling for isotype-1 b-tubulin analyses.In order to assess the molecular identification of GIN and determine the BZD resistance status of GIN parasitizing livestock, fecal samples from calves were collected between April 2020 and October 2021. The frequency of benzimidazole resistance alleles in parasitic nematodes communities was determined through deep amplicon sequencing of the isotype-1 b-tubulin and ITS2 genes, as previously described and detailed in Avramenko et al. (2019). The prepared pooled library was run on an Illumina Desktop Sequencer using a 500-cycle paired-end reagent kit (MiSeq Reagent Kit, v2, MS-103–2003) at a final concentration of 15 pM, with the addition of 25% PhiX control v3 (Illumina, FC-110-3001). The MiSeq was set to generate only FASTQ files.
dc.datacite.DescriptionType
Información Técnica
dc.datacite.FundingReference
00343-2020-PICT
dc.datacite.FunderName
Ministerio de Ciencia. Tecnología e Innovación Productiva. Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica
dc.subject.keyword
NEMABIOME
dc.subject.keyword
ISOTYPE-1 B-TUBULIN
dc.subject.keyword
ITS2 rDNA
dc.subject.keyword
CATTLE
dc.subject.keyword
PARASITES
dc.datacite.resourceTypeGeneral
dataset
dc.conicet.datoinvestigacionid
26139
dc.datacite.awardTitle
MONITOREO GENÉTICO DE LA RESISTENCIA ANTIHELMÍNTICA MEDIANTE SECUENCIACIÓN MASIVA DE AMPLICONES EN NEMATODOS GASTROINTESTINALES DEL BOVINO
dc.datacite.geolocation
Buenos Aires
dc.datacite.formatedDate
2025
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