Mostrar el registro sencillo del ítem
dc.date.available
2025-04-24T10:22:08Z
dc.identifier.citation
Allegrini, Marco; Villamil, Maria Bonita; Zabaloy, Maria Celina; (2025): Shifts in rhizospheric bacterial communities of perennial ryegrass after organic and inorganic fertilization. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/259442
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/259442
dc.description.abstract
The dataset comes from a 16S rRNA amplicon sequencing experiment using metagenomic DNA from rhizosphere soil samples of Lolium perenne L. This study aimed to evaluate the impact of different fertilization treatments (anaerobic digestate, urea, or the combination of both) on bacterial community structure, alpha diversity, and predicted functional profiles. The study was conducted in the greenhouse under a complete randomized design.
dc.rights
info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.title
Shifts in rhizospheric bacterial communities of perennial ryegrass after organic and inorganic fertilization
dc.type
dataset
dc.date.updated
2025-04-24T09:15:25Z
dc.description.fil
Fil: Allegrini, Marco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Villamil, Maria Bonita. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. University of Illinois; Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Zabaloy, Maria Celina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina
dc.rights.embargoDate
2030-04-22
dc.datacite.PublicationYear
2025
dc.datacite.Creator
Allegrini, Marco

dc.datacite.Creator
Villamil, Maria Bonita

dc.datacite.Creator
Zabaloy, Maria Celina

dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario

dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas

dc.datacite.affiliation
University of Illinois

dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida

dc.datacite.publisher
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
dc.datacite.subject
Ciencias del Suelo

dc.datacite.subject
Agricultura, Silvicultura y Pesca

dc.datacite.subject
CIENCIAS AGRÍCOLAS

dc.datacite.date
06-2024
dc.datacite.DateType
Creado

dc.datacite.language
eng
dc.datacite.version
1.0
dc.datacite.description
The study was conducted in the greenhouse under a complete randomized design with four fertilization treatments: unfertilized control, anaerobic digestate, inorganic fertilizer (urea), and combined fertilizer (urea + anaerobic digestate). Fertilizers were added at the same total dose (106 mg N-NH4+ g-1 soil, equal to 140 kg N-NH4+ ha-1). More details of the greenhouse experimental design can be found in Allegrini M, Iocoli GA, Zabaloy MC. Environ Sci Pollut Res. 2024;31(34):47132–47143. doi:10.1007/s11356-024-34279-6. DNA was extracted from soil samples using the commercial kit ADN Puriprep-Suelo kit (Inbio Highway, Tandil, Argentina). Sequencing was conducted at the DNA Service Laboratory, Roy J. Carver Biotechnology Center, University of Illinois (Urbana-Champaign, United States) using the primers V4_515F_New (5'-GTGYCAGCMGCCGCGGTAA-3') and V4_806R_New (5'-GGACTACNVGGGTWTCTAAT-3') on an Illumina MiSeq flowcell for 251 cycles from each end of the fragments (2x250 nt reads)
dc.datacite.DescriptionType
Métodos

dc.datacite.FundingReference
PICT 2020-02289
dc.datacite.FundingReference
978-802-ILLU
dc.datacite.FunderName
Ministerio de Ciencia. Tecnología e Innovación Productiva. Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica

dc.datacite.FunderName
United States Department of Agriculture

dc.subject.keyword
RHIZOSPHERE
dc.subject.keyword
MICROBIOME
dc.subject.keyword
ANAEROBIC DIGESTATE
dc.subject.keyword
PERENNIAL RYEGRASS
dc.datacite.resourceTypeGeneral
dataset
dc.conicet.datoinvestigacionid
27047
dc.datacite.awardTitle
microbioma-planta- Evaluación de la seguridad biológica y ambiental del uso de biofertilizante basado en digeridos anaeróbicos de estiércol y biocarbón sobre el sistema suelo
dc.datacite.geolocation
Soil sampling for greenhouse assay: 38° 25′ 39′′ S, 62° 17′ 41′′ W
dc.datacite.geolocation
Greenhouse location: 38° 41′ 41′′ S, 62° 15′ 08′′ W
dc.datacite.formatedDate
2024
Archivos del conjunto de datos
Archivo
Notas de uso
Tamaño
M39_DF_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
7.030Mb
M40_IF_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
6.317Mb
M31_IF_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
7.441Mb
M35_C_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
7.068Mb
M31_IF_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
7.931Mb
M16_C_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
5.826Mb
M16_C_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
5.454Mb
M35_C_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
7.624Mb
M15_DF_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
7.357Mb
M32_C_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
7.327Mb
M15_DF_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
7.812Mb
M26_IF_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
5.164Mb
M13_C_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
5.805Mb
Files_description.xlsx
Embargado hasta 22-04-2030
13.95Kb
M40_IF_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
5.981Mb
M5_DF_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
6.559Mb
M1_DF_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
8.758Mb
M21_DF_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
7.701Mb
M6_CF_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
5.104Mb
M5_DF_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
7.068Mb
M39_DF_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
7.419Mb
M21_DF_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
7.299Mb
M6_CF_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
5.412Mb
M1_DF_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
8.236Mb
M9_CF_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
8.880Mb
M34_CF_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
9.006Mb
M34_CF_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
8.260Mb
M9_CF_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
8.177Mb
M4_IF_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
7.145Mb
M26_IF_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
5.392Mb
M13_C_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
5.488Mb
M4_IF_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
6.782Mb
M32_C_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
6.901Mb
M12_C_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
5.326Mb
M12_C_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
5.161Mb
M10_CF_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
5.967Mb
M24_CF_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
6.696Mb
M24_CF_L001_R1_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
6.395Mb
M10_CF_L001_R2_001_fastq.gz
Embargado hasta 22-04-2030
6.383Mb